Det är juletid på Gotland och snart dags för jullov för Emil och hans kompisar. Men innan det börjar ska en extraordinär tillställning gå av stapeln, nämligen VM i pepparkakshus (vilket naturligtvis står för Visby mästerskap). Alla mellanstadiebarn på ön får vara med i tävlingen, och Emil, Ubbe, Alva och Sokrates sätter genast i gång att baka sina bidrag.

Men när tävlingsbidragen ställs ut är ett av pepparkakshusen spårlöst försvunnet! Juryn beslutar att skjuta på tävlingen ett dygn och om inte huset kommit tillrätta avgörs tävlingen ändå.

Det blir en rafflande kamp mot klockan för detektivgänget att hinna lista ut vem den skyldige är ...